62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0166 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  59.34 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  47.78 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  46.51 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  46.51 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  46.07 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  46.07 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  40.45 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  42.7 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  41.57 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  41.57 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  41.57 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  40.23 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  39.33 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  33.71 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  33.71 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  33.71 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0418  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104976  hitchhiker  0.00924869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0400  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0460  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000176876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0397  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56265  hitchhiker  0.00000000000262215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0406  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000937702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  33.78 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0360  hypothetical protein  38.3 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.503076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  30.34 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  32.97 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1056  hypothetical protein  40.28 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0400  hypothetical protein  37.23 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  31.46 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  33.71 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  32.58 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0395  hypothetical protein  37.23 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00288  hypothetical protein  37.23 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  33.71 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00284  hypothetical protein  37.23 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3295  hypothetical protein  37.23 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0353  hypothetical protein  37.23 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3277  protein of unknown function DUF1471  37.23 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  32.58 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  31.46 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  31.46 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  32.58 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  33.71 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  32.58 
 
 		 85 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  32.58 
 
 		 85 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  32.58 
 
 		 85 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>