33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3277 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3277  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3295  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00284  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00288  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0395  hypothetical protein  98.9 
 
 		 91 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0400  hypothetical protein  97.8 
 
 		 91 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0360  hypothetical protein  97.8 
 
 		 91 aa  175  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.503076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0400  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0397  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56265  hitchhiker  0.00000000000262215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0406  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000937702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0460  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000176876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0418  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104976  hitchhiker  0.00924869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1056  hypothetical protein  69.23 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  38.89 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  39.33 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  45.45 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  37.23 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  37.23 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  37.23 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  38.18 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  35.37 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  38.18 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  32.56 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>