53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4631 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  186  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  59.34 
 
 
89 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  59.34 
 
 
89 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  59.34 
 
 
89 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  52.17 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  46.74 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  46.74 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  46.74 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  46.74 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1056  hypothetical protein  49.43 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0107065  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0400  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0360  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.503076  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0395  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0400  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0460  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000176876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0418  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.104976  hitchhiker  0.00924869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0397  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56265  hitchhiker  0.00000000000262215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0406  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000937702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3295  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00284  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00288  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3277  protein of unknown function DUF1471  38.89 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0353  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  37.78 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  41.57 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  42.22 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  42.7 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  41.57 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  42.7 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  40.45 
 
 
87 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  40.45 
 
 
104 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  40.45 
 
 
87 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  40.45 
 
 
87 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  40.45 
 
 
87 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  40.45 
 
 
87 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  40.45 
 
 
87 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  39.33 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  39.33 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  31.46 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  31.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>