35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0093 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  98.96 
 
 
96 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  98.96 
 
 
96 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  46.74 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  46.51 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  46.51 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  46.51 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  39.56 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  40.45 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  34.88 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  41.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  41.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  41.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  41.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  41.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  39.13 
 
 
87 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  37.08 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  37.08 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  37.08 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  37.08 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  35.96 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  32.58 
 
 
87 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  32.58 
 
 
87 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  32.58 
 
 
87 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  35.96 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  35.96 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  35.96 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  35.96 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  35.96 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  35.96 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  35.96 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  34.41 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0034  protein of unknown function DUF1471  38.46 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  36.67 
 
 
86 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.977465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>