38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0445 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4658  protein YjfY  41.98 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4760  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4732  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4670  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.915297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3814  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0544212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4443  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04066  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5715  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3794  protein of unknown function DUF1471  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.040427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04028  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4668  protein YjfY  39.51 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.192543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  35.16 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  39.53 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4786  hypothetical protein  37.04 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4750  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  38.82 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  37.65 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  38.82 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  38.82 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  38.82 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  35.56 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  34.44 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  31.82 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  32.97 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  32.97 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  32.97 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  36.47 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  36.47 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  36.47 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  29.21 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>