20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4786 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4786  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4750  hypothetical protein  96.7 
 
 		 91 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4668  protein YjfY  70.33 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.192543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4658  protein YjfY  69.23 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3794  protein of unknown function DUF1471  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.040427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04028  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5715  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4732  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4670  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.915297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3814  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0544212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4443  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04066  hypothetical protein  83.33 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4760  hypothetical protein  81.94 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  65.93 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  37.04 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  37.84 
 
 		 87 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>