30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4443 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04066  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04028  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5715  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4732  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4670  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.915297  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3814  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0544212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4443  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3794  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.040427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4760  hypothetical protein  98.9 
 
 
91 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4658  protein YjfY  82.42 
 
 
91 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4668  protein YjfY  81.32 
 
 
91 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.192543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0370  hypothetical protein  76.92 
 
 
91 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114454  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4786  hypothetical protein  72.53 
 
 
92 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276955  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4750  hypothetical protein  72.53 
 
 
91 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0445  hypothetical protein  39.53 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  42.05 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  43.02 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  36.78 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  36.78 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  36.78 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  32.63 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  32.63 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  34.09 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  32.63 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  34.09 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  34.09 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  32.95 
 
 
87 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  32.95 
 
 
87 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  28.09 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  31.58 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>