54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4128 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4128  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 
88 aa  167  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4121  protein of unknown function DUF1471  94.32 
 
 
88 aa  160  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0034  protein of unknown function DUF1471  77.27 
 
 
83 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  70.45 
 
 
82 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  59.09 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  48.86 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0056  protein of unknown function DUF1471  60.23 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  48.86 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  55.17 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  48.31 
 
 
75 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  48.31 
 
 
75 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  53.41 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  52.27 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  52.27 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0739  protein of unknown function DUF1471  52.27 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  51.14 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  44.32 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  43.82 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  44.32 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  48.28 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0102  protein of unknown function DUF1471  52.87 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  42.7 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  42.7 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  42.7 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2621  hypothetical protein  43.68 
 
 
71 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  41.57 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  44.05 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4082  hypothetical protein  45.98 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.714562  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0031  hypothetical protein  43.18 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0972  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0887  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0951  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0919  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0860  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  48.86 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  48.86 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  48.86 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  48.86 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  48.86 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  48.86 
 
 
86 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  47.73 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  47.73 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0036  protein of unknown function DUF1471  42.05 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  41.46 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  32.89 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>