88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0739 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0739  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 
82 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0034  protein of unknown function DUF1471  60.24 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0056  protein of unknown function DUF1471  69.51 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  58.82 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  67.07 
 
 
82 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  55.29 
 
 
85 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4121  protein of unknown function DUF1471  55.68 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  52.44 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4128  protein of unknown function DUF1471  52.27 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  49.4 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  49.41 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  47.06 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  50.6 
 
 
75 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  49.4 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  45.35 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0031  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  41.18 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  45.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0036  protein of unknown function DUF1471  49.41 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0102  protein of unknown function DUF1471  52.44 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  43.53 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  47.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  44.16 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  44.16 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  44.16 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  46.51 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  44.16 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  44.16 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  43.21 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  43.21 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  43.21 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  43.21 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  43.21 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  43.21 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  43.21 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  38.2 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  38.2 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  40.74 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  38.2 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  39.51 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  40.23 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0919  hypothetical protein  44.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0887  hypothetical protein  44.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  40.74 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0951  hypothetical protein  44.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0972  hypothetical protein  44.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0860  hypothetical protein  44.19 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  38.82 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4631  hypothetical protein  29.67 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  39.51 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  37.04 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  48.65 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  40.74 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0093  probable secreted protein  35.23 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  32.18 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  32.18 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  32.18 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  36.84 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0088  hypothetical protein  34.09 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2621  hypothetical protein  38.1 
 
 
71 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0088  hypothetical protein  34.09 
 
 
96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2648  hypothetical protein  48.84 
 
 
86 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158517  hitchhiker  0.000000615567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0092  probable secreted protein  34.09 
 
 
96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>