67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0056 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0056  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 
82 aa  157  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0034  protein of unknown function DUF1471  65.06 
 
 
83 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4121  protein of unknown function DUF1471  62.5 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0739  protein of unknown function DUF1471  69.51 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  62.2 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4128  protein of unknown function DUF1471  60.23 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  63.41 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  58.02 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  49.41 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  49.4 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  49.4 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0102  protein of unknown function DUF1471  59.49 
 
 
81 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  44.05 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  42.86 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  47.67 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  52.38 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  45.88 
 
 
123 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0031  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  42.35 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  41.86 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0036  protein of unknown function DUF1471  45.88 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  40.23 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  41.98 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  40.23 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  36.78 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  29.07 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  29.07 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  29.07 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  32.56 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  35 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>