41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2077 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2077  protein of unknown function DUF1471  100 
 
 
316 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1860  protein of unknown function DUF1471  77.53 
 
 
312 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2109  hypothetical protein  67.92 
 
 
317 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2402  protein of unknown function DUF1471  67.3 
 
 
317 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2586  hypothetical protein  63.52 
 
 
316 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1863  hypothetical protein  62.46 
 
 
314 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335032  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1587  hypothetical protein  62.46 
 
 
314 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.48706  normal  0.33629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1646  hypothetical protein  62.46 
 
 
314 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1578  protein YdgH  62.46 
 
 
314 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1696  protein YdgH  62.46 
 
 
314 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00255729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2039  protein of unknown function DUF1471  62.46 
 
 
314 aa  355  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1595  YdgH protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332868  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2314  YdgH protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.842613  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01563  hypothetical protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.885779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1790  YdgH protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0421075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01573  hypothetical protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2026  hypothetical protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1679  YdgH protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.434998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1812  YdgH protein  62.46 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00909814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1829  hypothetical protein  61.13 
 
 
317 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2297  hypothetical protein  61.13 
 
 
317 aa  352  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1940  hypothetical protein  60.82 
 
 
317 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1848  hypothetical protein  60.57 
 
 
314 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156695  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  34.83 
 
 
87 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  34.83 
 
 
87 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  34.83 
 
 
87 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  35.96 
 
 
87 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  33.71 
 
 
87 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  33.71 
 
 
87 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  33.71 
 
 
87 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  32.58 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  32.58 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  32.58 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  32.58 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  32.58 
 
 
104 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  32.58 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  32.58 
 
 
87 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  34.44 
 
 
87 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  34.44 
 
 
87 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  35.16 
 
 
89 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  34.44 
 
 
87 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>