178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5360 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5360  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985584  normal  0.054926 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  60.64 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.5 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  58.16 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  55 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  59.89 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  55.1 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  56.12 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  55.85 
 
 		 191 aa  198  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  56.63 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  53.57 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  54.59 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  55.03 
 
 		 193 aa  194  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.67 
 
 		 193 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  55.05 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.97 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  53.97 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  53.97 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  52.91 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  53.44 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  54.87 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  52.94 
 
 		 192 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  52.91 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  55.32 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  52.94 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  50.51 
 
 		 201 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.38 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.55 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  51.53 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  51.37 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  51.37 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  50.53 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  49.73 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  52.13 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.68 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.85 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  52.38 
 
 		 193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.49 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  49.45 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  48.68 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.59 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.03 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.86 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  57.22 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  51.6 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  57.14 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  51.79 
 
 		 233 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.27 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.09 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  49.73 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  51.89 
 
 		 811 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  47.59 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.4 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  48.4 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  47.57 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.72 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.6 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.45 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.97 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  47.34 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5924  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.74 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  46.24 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.24 
 
 		 207 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.11 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1512  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.04 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.9 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3490  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.7 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0438867  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  44.57 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.28 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1018  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.46 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.54573  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.23 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  44.57 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  44.57 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0710  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.19 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  44.57 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  44.02 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  46.32 
 
 		 228 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  46.45 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  46.32 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  46.32 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3780  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.48 
 
 		 227 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.73 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.85 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  45.9 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  45.9 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.9 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  45.9 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  45.36 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  45.9 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27040  K+-transporting ATPase, C subunit  49.14 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>