193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3323 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  39.51 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  39.6 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0822  Glutathione S-transferase domain protein  41.5 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4673  putative glutathione S-transferase (modular protein)  30.85 
 
 		 500 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  32.69 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  24.69 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  25.29 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  27.87 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  26.47 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  23.03 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  25.99 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  26.38 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  26.37 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1819  Glutathione S-transferase domain protein  24.29 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820795  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.15 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  23.42 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.75 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.42 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03255  glutathione transferase 1 (Eurofung)  26.32 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  23.73 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.17 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  27.84 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  27.98 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  28.07 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.22 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  27.33 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  28.07 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  27.49 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.6 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  28.07 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  28.07 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  24.88 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.21 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  24.88 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.39 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.26 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  26.78 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.78 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  26.82 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  21.29 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  22.9 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  24.56 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.95 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  25.86 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.03 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  25.7 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  24.39 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0899  glutathione S-transferase family protein  26.51 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.717795  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  27.22 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  31.25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  26.92 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  27.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  25.25 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  26.82 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.74 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  26.06 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2508  glutathione S-transferase family protein  26.79 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.122319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.26 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  27.01 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.04 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00805  predicted glutathione S-transferase  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2804  Glutathione S-transferase domain protein  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  27.04 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00822  hypothetical protein  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  22.84 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  21.89 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  22.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  25 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  27.91 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2804  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  23.24 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0990  glutathione S-transferase family protein  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.472621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0864  glutathione S-transferase family protein  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0908  glutathione S-transferase family protein  26.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  27.5 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  25.27 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  24.71 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  26.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  34.41 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.84 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  27.91 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.54 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  21.56 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1623  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.91 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.08 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1994  glutathione S-transferase-like  26.28 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>