39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1470 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  860    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  55.5 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  51.72 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  55.85 
 
 		 411 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  50.24 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  51.31 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  45.83 
 
 		 384 aa  358  9e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  41.25 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  29.23 
 
 		 686 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  30.39 
 
 		 616 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  28.61 
 
 		 618 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  29.97 
 
 		 678 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  28.33 
 
 		 618 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  28.77 
 
 		 616 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  31.43 
 
 		 663 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  29.97 
 
 		 584 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  26.61 
 
 		 615 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  25.63 
 
 		 626 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  28.29 
 
 		 637 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  28.98 
 
 		 741 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  27.01 
 
 		 611 aa  86.3  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  29.56 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  29.3 
 
 		 649 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  28.02 
 
 		 641 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  28.03 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  30.04 
 
 		 626 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  28.36 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  29.21 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.80619 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 735 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 689 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  26.4 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  26.96 
 
 		 676 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  26.29 
 
 		 677 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 699 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  26.3 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  26.3 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  26.3 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>