39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7340 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  59.93 
 
 		 617 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  58.47 
 
 		 618 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  75.45 
 
 		 616 aa  967    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1248    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  59.28 
 
 		 618 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  75.24 
 
 		 616 aa  976    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  49.05 
 
 		 626 aa  534  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  49.46 
 
 		 584 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  42.44 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  45.7 
 
 		 632 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  37.39 
 
 		 605 aa  402  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  35.83 
 
 		 654 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 		 735 aa  286  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  34.11 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  34.8 
 
 		 689 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 		 699 aa  243  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  29.51 
 
 		 632 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  35.6 
 
 		 678 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  30.35 
 
 		 637 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  28.94 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  31.74 
 
 		 686 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  30.85 
 
 		 663 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  30.65 
 
 		 651 aa  144  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  31.14 
 
 		 676 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  30.3 
 
 		 741 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  31.17 
 
 		 649 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  32.4 
 
 		 641 aa  134  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  30.28 
 
 		 677 aa  124  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  29.48 
 
 		 418 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  26.67 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  26.67 
 
 		 495 aa  101  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  26.67 
 
 		 495 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  28.85 
 
 		 384 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  28.21 
 
 		 418 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  29.18 
 
 		 406 aa  91.3  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  26.61 
 
 		 419 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  27.33 
 
 		 418 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  28.03 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>