39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5047 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  58.69 
 
 		 617 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  58.08 
 
 		 618 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1243    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  75.45 
 
 		 615 aa  967    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  59.38 
 
 		 618 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  87.46 
 
 		 616 aa  1107    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  46 
 
 		 626 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  49.13 
 
 		 584 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  45.76 
 
 		 632 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  43.28 
 
 		 611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  37.02 
 
 		 605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  36.57 
 
 		 654 aa  346  8.999999999999999e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 		 735 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 689 aa  279  9e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  32.07 
 
 		 699 aa  265  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  29.94 
 
 		 632 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  31.03 
 
 		 686 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  31.91 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  28.71 
 
 		 626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  31.61 
 
 		 741 aa  140  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  30.75 
 
 		 649 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  29.34 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  29.45 
 
 		 663 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  29.38 
 
 		 676 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  32.27 
 
 		 651 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  34.08 
 
 		 641 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  30.59 
 
 		 677 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  27.2 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  25.96 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  25.96 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  25.96 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  28.25 
 
 		 418 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  28.77 
 
 		 419 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  27.3 
 
 		 418 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  27.19 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  27.2 
 
 		 406 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  26.49 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  24.92 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>