39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1295 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  845    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  67.08 
 
 
418 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  57.14 
 
 
406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  55.85 
 
 
419 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  53.02 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  52.51 
 
 
418 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  47.63 
 
 
384 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  41.33 
 
 
418 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  29 
 
 
618 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  28.46 
 
 
618 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  26.9 
 
 
626 aa  94  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  30.04 
 
 
637 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  29.59 
 
 
686 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  29.27 
 
 
663 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 
654 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  28.93 
 
 
617 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  26.4 
 
 
741 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  28.57 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  28.19 
 
 
641 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  27.2 
 
 
584 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  26.49 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  28.03 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  27.62 
 
 
616 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  29.02 
 
 
676 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  27.24 
 
 
649 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 
518 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  24.87 
 
 
678 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  26.05 
 
 
605 aa  76.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.80619 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
689 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  27.94 
 
 
651 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  27.27 
 
 
611 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  27.14 
 
 
632 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 
735 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  24.42 
 
 
495 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  24.27 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  24.42 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  25.71 
 
 
632 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  26.05 
 
 
677 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 
699 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>