39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2681 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  100 
 
 
678 aa  1340    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  47.66 
 
 
676 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  47.04 
 
 
651 aa  472  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  44.99 
 
 
741 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  45.48 
 
 
686 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  43.18 
 
 
632 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  46.09 
 
 
649 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  41.18 
 
 
677 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  40.58 
 
 
626 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  38.22 
 
 
641 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  36.5 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  36 
 
 
663 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  33.25 
 
 
618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  34.11 
 
 
618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  41.34 
 
 
584 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  27.77 
 
 
605 aa  167  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  32.78 
 
 
611 aa  167  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  35.1 
 
 
632 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  35.6 
 
 
615 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  30.23 
 
 
617 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  29.63 
 
 
626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  32.06 
 
 
616 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  31.91 
 
 
616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 
654 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 
699 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
735 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 
689 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 
518 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  27.2 
 
 
495 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  27.2 
 
 
495 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  26.94 
 
 
495 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  27.08 
 
 
418 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  29.97 
 
 
419 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  25.26 
 
 
406 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  27.37 
 
 
384 aa  92  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  26.88 
 
 
418 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  26.03 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  24.87 
 
 
411 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  25.26 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>