38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3947 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  869    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  42.69 
 
 
418 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  40.72 
 
 
406 aa  305  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  42.55 
 
 
384 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  41.33 
 
 
411 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  41.25 
 
 
419 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  40.21 
 
 
418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  39.79 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  25.99 
 
 
641 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  28.26 
 
 
605 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  30.08 
 
 
626 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  27.44 
 
 
741 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  28.66 
 
 
632 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  27.33 
 
 
615 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  27.65 
 
 
686 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  25.16 
 
 
618 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  25.27 
 
 
618 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  27 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  24.46 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  26.44 
 
 
611 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  24.36 
 
 
617 aa  80.1  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  27.87 
 
 
649 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  26.12 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  27.21 
 
 
676 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  25.78 
 
 
632 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  27.03 
 
 
651 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  25.35 
 
 
678 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  27.13 
 
 
584 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  24.92 
 
 
616 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  26.64 
 
 
663 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  23.12 
 
 
495 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  23.12 
 
 
495 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
689 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  23.45 
 
 
495 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  22.22 
 
 
654 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  25.72 
 
 
677 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  23.2 
 
 
735 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>