38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  100 
 
 		 677 aa  1328    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  49.05 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  46.98 
 
 		 651 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  45.71 
 
 		 676 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  44.35 
 
 		 649 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  41.14 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  38.68 
 
 		 741 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  38.99 
 
 		 632 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  36.04 
 
 		 626 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  34.26 
 
 		 637 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  33.71 
 
 		 641 aa  243  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  42.04 
 
 		 663 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  32.83 
 
 		 605 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  26.72 
 
 		 626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  32.43 
 
 		 616 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  32.45 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  30.59 
 
 		 616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  30.28 
 
 		 615 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  31.9 
 
 		 611 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  31.36 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  29.18 
 
 		 618 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  29.23 
 
 		 618 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  30.79 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 735 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 689 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  26.79 
 
 		 495 aa  94.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  26.79 
 
 		 495 aa  94.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  25.77 
 
 		 495 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.854489 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 699 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  29.72 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  26.29 
 
 		 419 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  25.41 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  25.72 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  25.07 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  26.05 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  23.89 
 
 		 384 aa  51.6  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>