39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57213 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  100 
 
 
626 aa  1306    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  49.05 
 
 
615 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  46 
 
 
616 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  45.83 
 
 
616 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  43.78 
 
 
617 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  44.25 
 
 
618 aa  475  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  44.25 
 
 
618 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  41.18 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  40.2 
 
 
632 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  39.51 
 
 
584 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  34.22 
 
 
605 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
654 aa  276  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 
735 aa  250  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
689 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  40 
 
 
518 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 
699 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  27.55 
 
 
626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  28.88 
 
 
632 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  29.63 
 
 
678 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  30.08 
 
 
651 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  29.87 
 
 
663 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  28.2 
 
 
686 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  26.69 
 
 
649 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  31.05 
 
 
741 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  27.6 
 
 
676 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  27.86 
 
 
641 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  29.91 
 
 
637 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  26.72 
 
 
677 aa  124  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  26.44 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  27.5 
 
 
418 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  24.06 
 
 
495 aa  97.8  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  24.06 
 
 
495 aa  97.4  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  24.83 
 
 
495 aa  97.8  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  26.9 
 
 
411 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  25.63 
 
 
419 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  24.39 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  25.62 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  24.46 
 
 
418 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>