39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0930 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1038    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  98.79 
 
 
495 aa  1025    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.854489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  99.6 
 
 
495 aa  1034    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  30.39 
 
 
632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  26.48 
 
 
641 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  28.68 
 
 
649 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  27.2 
 
 
678 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  29.55 
 
 
626 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  30.94 
 
 
611 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  29.46 
 
 
686 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  29.01 
 
 
605 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  27.4 
 
 
632 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  28.96 
 
 
584 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  25.96 
 
 
616 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  25.91 
 
 
676 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  26.67 
 
 
615 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  24.91 
 
 
616 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  27.08 
 
 
741 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  29.29 
 
 
618 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  28.19 
 
 
618 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  24.06 
 
 
626 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  30.48 
 
 
663 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  26.7 
 
 
637 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  28.31 
 
 
651 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  26.28 
 
 
677 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
518 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  26.1 
 
 
617 aa  87  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 
735 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  22.62 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 
689 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  23.19 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 
654 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  24.05 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  23.12 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  24.42 
 
 
411 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 
699 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  26.3 
 
 
419 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  20.07 
 
 
384 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  23.91 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>