39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0132 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0132  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1269    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2681  hypothetical protein  43.18 
 
 
678 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0942599  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21300  hypothetical protein  41.38 
 
 
686 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00049361  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3809  hypothetical protein  44.06 
 
 
676 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502089  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2921  hypothetical protein  41.82 
 
 
651 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1593  hypothetical protein  40.59 
 
 
637 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3562  hypothetical protein  41.88 
 
 
649 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03430  hypothetical protein  39 
 
 
741 aa  363  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316683  normal  0.637464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6378  hypothetical protein  37.73 
 
 
626 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29050  hypothetical protein  38.52 
 
 
677 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  38.11 
 
 
641 aa  300  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6719  hypothetical protein  37.5 
 
 
663 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5047  hypothetical protein  29.94 
 
 
616 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193591  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4008  hypothetical protein  28.57 
 
 
618 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5330  hypothetical protein  29.28 
 
 
616 aa  160  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7340  hypothetical protein  29.51 
 
 
615 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4337  hypothetical protein  35.26 
 
 
618 aa  157  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78015  hitchhiker  0.0000641887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3435  hypothetical protein  29.02 
 
 
605 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.80619 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57213  hypothetical conserved protein of unknown function  28.88 
 
 
626 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3410  hypothetical protein  35.16 
 
 
611 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36223  normal  0.559533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3580  hypothetical protein  28.79 
 
 
617 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3533  hypothetical protein  28.47 
 
 
584 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.644832  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3902  Uncharacterized conserved protein UCP014753  33.15 
 
 
632 aa  143  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.079236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0930  hypothetical protein  30.39 
 
 
495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0983  hypothetical protein  30.13 
 
 
495 aa  142  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3365  hypothetical protein  30.36 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.854489 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08424  conserved hypothetical protein  30 
 
 
689 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0202574  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03992  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 
735 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07089  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 
699 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6822  hypothetical protein  28.37 
 
 
418 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0924507  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4103  hypothetical protein  28.61 
 
 
406 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02610  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 
654 aa  97.1  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05733  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
518 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3947  hypothetical protein  28.66 
 
 
418 aa  88.2  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174675  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2279  hypothetical protein  27.99 
 
 
406 aa  87.4  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1470  hypothetical protein  28.36 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2239  hypothetical protein  25.68 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0313142  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1690  hypothetical protein  26.09 
 
 
384 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1295  hypothetical protein  27.14 
 
 
411 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.306909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>