23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  56.43 
 
 		 169 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  47.29 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  41.76 
 
 		 175 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  43.85 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  36.97 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  44.09 
 
 		 165 aa  98.2  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  97.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  38.28 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  35.04 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  28.66 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  28.79 
 
 		 544 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  27.61 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  26.38 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  27.87 
 
 		 544 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  26.73 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1048  hypothetical protein  31.36 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>