23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  58.47 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  49.5 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  48.57 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  48.92 
 
 		 145 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  47.29 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  48.46 
 
 		 156 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  44 
 
 		 169 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  44.06 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  33.83 
 
 		 153 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  38.76 
 
 		 158 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  40.31 
 
 		 158 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  33.82 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  31.63 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  38.26 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  28.79 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  27.13 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  28.26 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  26.71 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3365  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.882109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>