20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3539 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  90.72 
 
 		 194 aa  354  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  53.9 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  32.54 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  32.54 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  28.17 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  29.69 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  27.48 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  33.1 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  26.38 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  25.71 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  24.81 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  30.43 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  26.72 
 
 		 544 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3365  hypothetical protein  25.36 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.882109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  25.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  24.62 
 
 		 544 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  22.76 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.795639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>