20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1045 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  363  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  42.01 
 
 
194 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  37.36 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  45.11 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  38.76 
 
 
229 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  28.03 
 
 
193 aa  84.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  37.69 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  31.5 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  31.03 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  34.04 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  31.82 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  32.58 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  26.21 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  32.53 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  25.17 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  24.81 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  32.94 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>