20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6008 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  37.14 
 
 
144 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  29.92 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  34 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  28.36 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  27.93 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  25.55 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  29.7 
 
 
158 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  25.22 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  27.5 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  30.43 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  28.07 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  23.81 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  27.82 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  24.78 
 
 
544 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  23.36 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  22.76 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  24.03 
 
 
544 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>