22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1554 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  342  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  60.87 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  50 
 
 
213 aa  140  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  44.79 
 
 
193 aa  137  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  48.1 
 
 
229 aa  136  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  48.82 
 
 
156 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  37.36 
 
 
175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  32.95 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  39.31 
 
 
153 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  40.14 
 
 
145 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  43.14 
 
 
165 aa  98.2  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  40.82 
 
 
158 aa  94.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  41.5 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  39.85 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  34 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  32.54 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  34.4 
 
 
544 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  30.95 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  34.58 
 
 
544 aa  63.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  33.88 
 
 
212 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  27.12 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>