23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2988 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  50.36 
 
 
229 aa  140  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  46.67 
 
 
156 aa  140  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  49.29 
 
 
193 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  44.76 
 
 
213 aa  137  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  43.95 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  44.83 
 
 
169 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  44.09 
 
 
194 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  41.33 
 
 
180 aa  120  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  41.18 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  37.69 
 
 
175 aa  101  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  35.97 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  33.58 
 
 
194 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  31.54 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  29.55 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  32.77 
 
 
544 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  33.05 
 
 
544 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  28.8 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  30.3 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  28.1 
 
 
212 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3365  hypothetical protein  29.73 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.882109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>