23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1249 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  60.87 
 
 
173 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  56.43 
 
 
194 aa  157  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  40.69 
 
 
156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  45.14 
 
 
213 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  46.15 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  45.38 
 
 
193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  45.11 
 
 
175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  40.77 
 
 
153 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  44.83 
 
 
165 aa  99  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  37.69 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  36.43 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  35.11 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  35.11 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  32.35 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  31.82 
 
 
544 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  32.54 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  30.28 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  29.6 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  29.46 
 
 
544 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1229  hypothetical protein  24.44 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  27.2 
 
 
144 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>