18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2421 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  298  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  36.23 
 
 
196 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  30.33 
 
 
213 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  27.19 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  30.71 
 
 
229 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  29.09 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  27 
 
 
153 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  25.38 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  29.09 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  32.94 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  27.12 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  26.73 
 
 
194 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  28.8 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  27.2 
 
 
169 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  31.58 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3365  hypothetical protein  23.02 
 
 
160 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.882109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>