21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1392 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  92.99 
 
 		 158 aa  292  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  45.45 
 
 		 544 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  45.11 
 
 		 544 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  40.31 
 
 		 213 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  41.5 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  92.8  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  35.43 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  32.31 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  35.11 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  33.05 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  32.58 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  30.65 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  31.82 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  35.66 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  29.09 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  33.66 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  27.69 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5952  hypothetical protein  33.98 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>