22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2440 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  299  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  48.92 
 
 		 213 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  46.76 
 
 		 193 aa  140  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  46.04 
 
 		 229 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  40.14 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  33.81 
 
 		 180 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  37.88 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  34.65 
 
 		 194 aa  84  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  33.9 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  31.5 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  33.05 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  66.6  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  33.02 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  30.95 
 
 		 544 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  30.16 
 
 		 544 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  23.81 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.795639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  27.2 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2421  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  25.78 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  25.78 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>