19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3914 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  90.72 
 
 		 194 aa  354  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  42.13 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  32.35 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  28.49 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  30.95 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  28.79 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  27.82 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  31.54 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  27.61 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  27.41 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  27.14 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1045  hypothetical protein  25.17 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2441  hypothetical protein  27.89 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  29.82 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  27.13 
 
 		 544 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  25 
 
 		 544 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3365  hypothetical protein  24.82 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.882109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  25.78 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>