More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22910  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  60.59 
 
 
637 aa  647    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0776  heavy metal translocating P-type ATPase  60.03 
 
 
630 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634796  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11850  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  100 
 
 
678 aa  1280    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  67.38 
 
 
679 aa  729    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  52.54 
 
 
655 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  52.63 
 
 
651 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5371  heavy metal translocating P-type ATPase  58.19 
 
 
652 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  57.48 
 
 
652 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  56.08 
 
 
656 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  55.36 
 
 
656 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  51.58 
 
 
654 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  53.27 
 
 
656 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  56.89 
 
 
655 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  56.61 
 
 
655 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  56.61 
 
 
655 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2207  heavy metal translocating P-type ATPase  52.32 
 
 
656 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  51.77 
 
 
655 aa  568  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  54.85 
 
 
651 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1792  heavy metal translocating P-type ATPase  54.83 
 
 
722 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0266735  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  53.32 
 
 
712 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5391  heavy metal translocating P-type ATPase  55.84 
 
 
660 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0505  heavy metal translocating P-type ATPase  55.84 
 
 
660 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5411  heavy metal translocating P-type ATPase  55.84 
 
 
660 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.043648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3097  heavy metal translocating P-type ATPase  52.57 
 
 
670 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0656722  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  52.33 
 
 
710 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.45 
 
 
723 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.724318  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  52.33 
 
 
710 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1493  heavy metal translocating P-type ATPase  51.45 
 
 
723 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122984  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4476  heavy metal translocating P-type ATPase  54.11 
 
 
650 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  54.11 
 
 
650 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.823072  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4207  heavy metal translocating P-type ATPase  54.11 
 
 
650 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  52.33 
 
 
710 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12024  metal cation transporter P-type ATPase G ctpG  56.58 
 
 
771 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.350952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2831  heavy metal translocating P-type ATPase  54.06 
 
 
705 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  41.52 
 
 
635 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  38.62 
 
 
707 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.26 
 
 
783 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 
637 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  36.32 
 
 
712 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
712 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  35.93 
 
 
712 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
767 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
800 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
799 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
800 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  39.52 
 
 
800 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  40.81 
 
 
830 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
713 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
750 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 
833 aa  360  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  41.87 
 
 
639 aa  356  7.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
870 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
869 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
712 aa  355  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
984 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
851 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
984 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
851 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  38.63 
 
 
868 aa  352  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
713 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  36.64 
 
 
800 aa  351  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  36.64 
 
 
800 aa  351  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
726 aa  351  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.12 
 
 
709 aa  350  4e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  36.6 
 
 
752 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
834 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
834 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
832 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  40.77 
 
 
793 aa  350  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
852 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
713 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
832 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
785 aa  350  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
734 aa  350  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  39.86 
 
 
828 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
825 aa  347  3e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
748 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.07 
 
 
738 aa  347  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 
639 aa  347  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.74 
 
 
752 aa  346  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  35.33 
 
 
677 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  38.75 
 
 
712 aa  346  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  38.59 
 
 
701 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
904 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 
939 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
801 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  35.51 
 
 
735 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.07 
 
 
750 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  40.66 
 
 
742 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
750 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
796 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
673 aa  343  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 
738 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  37.96 
 
 
750 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
748 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.64 
 
 
769 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  37.96 
 
 
709 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  37.37 
 
 
799 aa  342  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  39.01 
 
 
873 aa  341  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
812 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>