53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2512 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  93.11 
 
 		 697 aa  1337    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  88.78 
 
 		 695 aa  1300    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  72.78 
 
 		 698 aa  1043    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  88.49 
 
 		 695 aa  1297    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  67.53 
 
 		 699 aa  1009    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  69.42 
 
 		 703 aa  1049    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  88.63 
 
 		 695 aa  1299    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  82.41 
 
 		 704 aa  1161    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  70.39 
 
 		 699 aa  1061    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  88.35 
 
 		 695 aa  1295    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  64.32 
 
 		 693 aa  927    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  99.28 
 
 		 695 aa  1414    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  69.06 
 
 		 695 aa  1012    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  99.57 
 
 		 695 aa  1416    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  100 
 
 		 695 aa  1421    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  40.46 
 
 		 669 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  40.31 
 
 		 668 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  41.65 
 
 		 668 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  40.66 
 
 		 668 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  38.74 
 
 		 706 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  38.18 
 
 		 711 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  40.66 
 
 		 668 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  38.18 
 
 		 669 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  40.65 
 
 		 674 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  36.9 
 
 		 716 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  37.5 
 
 		 712 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  37.22 
 
 		 712 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  36.62 
 
 		 716 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  36.62 
 
 		 716 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  36.76 
 
 		 716 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  36.83 
 
 		 712 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  36.6 
 
 		 712 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  36.52 
 
 		 703 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  36.71 
 
 		 667 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  37.36 
 
 		 672 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  36.3 
 
 		 662 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  36.57 
 
 		 667 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  36.15 
 
 		 662 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  36.08 
 
 		 667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  35.11 
 
 		 698 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  34.42 
 
 		 672 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  34.52 
 
 		 669 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  26.22 
 
 		 660 aa  185  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  25.28 
 
 		 656 aa  160  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  25.43 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  25 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.53 
 
 		 772 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  23.82 
 
 		 573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  22.97 
 
 		 835 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.6 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  21.77 
 
 		 830 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.42 
 
 		 807 aa  82  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.04 
 
 		 810 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>