51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2229 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  52.37 
 
 		 669 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  52.38 
 
 		 668 aa  713    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  62.82 
 
 		 662 aa  895    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  51.79 
 
 		 668 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  100 
 
 		 667 aa  1368    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  63.27 
 
 		 662 aa  895    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  52.37 
 
 		 668 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  96.1 
 
 		 667 aa  1321    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  95.2 
 
 		 667 aa  1310    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  52.08 
 
 		 674 aa  679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  48.66 
 
 		 669 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  52.08 
 
 		 668 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  47.1 
 
 		 672 aa  621  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  36.3 
 
 		 699 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  37.02 
 
 		 693 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  35.73 
 
 		 703 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  35.23 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  36.73 
 
 		 672 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  37.21 
 
 		 669 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  35.27 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  35.94 
 
 		 695 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  36.08 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  34.9 
 
 		 695 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  34.9 
 
 		 695 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  34.9 
 
 		 695 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  35.94 
 
 		 695 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  34.76 
 
 		 695 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  34.99 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  33.33 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  34.83 
 
 		 704 aa  351  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  29.5 
 
 		 712 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  30.64 
 
 		 706 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  29.65 
 
 		 712 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  29.86 
 
 		 716 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  29.36 
 
 		 712 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  29.44 
 
 		 716 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  29.72 
 
 		 716 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  29.86 
 
 		 716 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  28.94 
 
 		 712 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  30.52 
 
 		 703 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  28.82 
 
 		 711 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  27.71 
 
 		 656 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  26.29 
 
 		 698 aa  230  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  28.44 
 
 		 573 aa  195  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  27.64 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.9 
 
 		 660 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  24.49 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  23.27 
 
 		 681 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  19.09 
 
 		 835 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  19.29 
 
 		 772 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.02 
 
 		 807 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>