34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2959 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  72.82 
 
 		 810 aa  1209    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  100 
 
 		 830 aa  1705    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  23.39 
 
 		 835 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.24 
 
 		 807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  24.21 
 
 		 703 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  24.49 
 
 		 699 aa  96.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  22.32 
 
 		 698 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  21.77 
 
 		 695 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  21.77 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  21.59 
 
 		 695 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  21.64 
 
 		 699 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  22.07 
 
 		 681 aa  74.7  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  21.67 
 
 		 697 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  21.55 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  21.36 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  21.29 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  21.11 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  21.36 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  21.49 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  21.26 
 
 		 712 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  22.13 
 
 		 698 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  21.67 
 
 		 703 aa  63.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  22.4 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  21.1 
 
 		 712 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  21.92 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  21.61 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  20.71 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  21.32 
 
 		 704 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  21.36 
 
 		 716 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  22.2 
 
 		 711 aa  53.5  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  21.64 
 
 		 706 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  24.38 
 
 		 672 aa  52.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  21.09 
 
 		 716 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.11 
 
 		 772 aa  44.3  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>