35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0816 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  73.31 
 
 		 830 aa  1212    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 810 aa  1660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  25.75 
 
 		 807 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  24.48 
 
 		 835 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  24.13 
 
 		 703 aa  89.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  22.53 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  22.79 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  22.61 
 
 		 699 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  21.83 
 
 		 699 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  21.75 
 
 		 695 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  21.75 
 
 		 695 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  21.56 
 
 		 695 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  21.75 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  21.69 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  21.23 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  21.15 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  20.76 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  21.23 
 
 		 695 aa  65.1  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  20.78 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  24 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  20.87 
 
 		 697 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  23.5 
 
 		 711 aa  55.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  21.87 
 
 		 698 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  26.85 
 
 		 712 aa  53.5  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  23.57 
 
 		 672 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  23.2 
 
 		 716 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  23.12 
 
 		 716 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  21.48 
 
 		 716 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  24.59 
 
 		 674 aa  48.5  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  25.11 
 
 		 712 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  25.11 
 
 		 712 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  21.71 
 
 		 672 aa  48.5  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  24.66 
 
 		 712 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  20 
 
 		 704 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  21.66 
 
 		 716 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>