53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2527 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  69.9 
 
 		 697 aa  1044    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  70.24 
 
 		 695 aa  1061    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  79.97 
 
 		 698 aa  1173    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  70.1 
 
 		 695 aa  1061    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  76.25 
 
 		 699 aa  1139    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  78.66 
 
 		 703 aa  1184    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  70.1 
 
 		 695 aa  1061    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  65.16 
 
 		 704 aa  934    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  100 
 
 		 699 aa  1445    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  70.1 
 
 		 695 aa  1059    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  60.8 
 
 		 693 aa  897    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  70.53 
 
 		 695 aa  1036    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  62.52 
 
 		 695 aa  942    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  70.67 
 
 		 695 aa  1040    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  70.39 
 
 		 695 aa  1036    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  39.52 
 
 		 668 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  40.08 
 
 		 669 aa  502  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  41.37 
 
 		 668 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  38.49 
 
 		 711 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  39.6 
 
 		 668 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  40.54 
 
 		 674 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  40.03 
 
 		 668 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  38.8 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  36.83 
 
 		 716 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  37.07 
 
 		 712 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  36.38 
 
 		 716 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  36.69 
 
 		 716 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  36.54 
 
 		 716 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  37.77 
 
 		 712 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  37.48 
 
 		 712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  36.38 
 
 		 703 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  37.2 
 
 		 712 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  37.11 
 
 		 669 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  37.7 
 
 		 672 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  35.95 
 
 		 662 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  35.37 
 
 		 667 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  35.37 
 
 		 667 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  35.52 
 
 		 662 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  35.23 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  34.48 
 
 		 698 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  34.87 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  33.15 
 
 		 672 aa  351  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  26.21 
 
 		 656 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.04 
 
 		 660 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  25.41 
 
 		 681 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  25.59 
 
 		 565 aa  138  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  25.66 
 
 		 573 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.35 
 
 		 772 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  23.77 
 
 		 835 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.82 
 
 		 807 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.45 
 
 		 706 aa  94.7  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  22.08 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.83 
 
 		 810 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>