53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1587 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  88.09 
 
 
697 aa  1286    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  99.57 
 
 
695 aa  1421    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  72.06 
 
 
698 aa  1050    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  99.14 
 
 
695 aa  1417    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  67.38 
 
 
699 aa  1015    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  68.85 
 
 
703 aa  1050    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  99.28 
 
 
695 aa  1419    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  82.13 
 
 
704 aa  1159    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  70.1 
 
 
699 aa  1059    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  100 
 
 
695 aa  1428    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  62.88 
 
 
693 aa  915    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  88.49 
 
 
695 aa  1272    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  67.63 
 
 
695 aa  1004    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  88.35 
 
 
695 aa  1269    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  88.35 
 
 
695 aa  1269    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  40.03 
 
 
669 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  39.02 
 
 
706 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  38.75 
 
 
668 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  38.14 
 
 
711 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  39.94 
 
 
668 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  39.8 
 
 
668 aa  475  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  39.37 
 
 
668 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  37.18 
 
 
669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  36.2 
 
 
716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  36.22 
 
 
712 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  36.52 
 
 
703 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  36.35 
 
 
712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  35.92 
 
 
716 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  39.09 
 
 
674 aa  445  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  35.83 
 
 
712 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  35.35 
 
 
716 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  35.65 
 
 
712 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  35.49 
 
 
716 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  37.64 
 
 
672 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  35.29 
 
 
667 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  34.43 
 
 
662 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  35 
 
 
667 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  34.1 
 
 
698 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  34.76 
 
 
667 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  34.15 
 
 
662 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  33.62 
 
 
669 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  32.72 
 
 
672 aa  342  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.59 
 
 
660 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  24.82 
 
 
656 aa  163  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  25 
 
 
681 aa  141  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  23.23 
 
 
772 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  24.11 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  22.09 
 
 
835 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  21.92 
 
 
706 aa  87.4  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.33 
 
 
807 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  20.93 
 
 
830 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.38 
 
 
810 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>