94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2563 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  98.28 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  98.28 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  97.7 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  93.1 
 
 		 174 aa  334  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  91.38 
 
 		 174 aa  330  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  91.38 
 
 		 174 aa  330  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  91.38 
 
 		 174 aa  330  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  90.8 
 
 		 174 aa  328  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  85.63 
 
 		 174 aa  313  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  85.06 
 
 		 174 aa  307  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  85.06 
 
 		 174 aa  307  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  82.76 
 
 		 174 aa  299  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  81.61 
 
 		 174 aa  298  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  81.61 
 
 		 174 aa  296  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  79.89 
 
 		 174 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000784281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000218944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.0000303245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000203492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  0.000000000000230682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  0.00000000052483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985112  hitchhiker  0.0000661717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000850849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  42.53 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000145299  hitchhiker  0.00000000000156783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  43.68 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  41.95 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  41.95 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000120656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  43.68 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  42.53 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  41.38 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  41.71 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  40.8 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000831476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  40.8 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000257627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  41.38 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002991  hypothetical protein YceD (clustered with ribosomal protein L32p)  44.25 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000352576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722055  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000825555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02913  hypothetical protein  41.95 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  37.36 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  40.23 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000844005  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  37.93 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  36.63 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  29.31 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  32.76 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  32.95 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  33.91 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  27.43 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  30.86 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  32.76 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  30.23 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  29.24 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  32.32 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  27.81 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  29.65 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  27.01 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  27.01 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  36.44 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  32.45 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  27.95 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4161  hypothetical protein  32.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  31.68 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3804  hypothetical protein  31.36 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1521  hypothetical protein  31.36 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000222818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1486  hypothetical protein  30.41 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  28.18 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  32.2 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  29.82 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  32.7 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1871  hypothetical protein  27.12 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3836  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1643  hypothetical protein  31.36 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17907  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  27.65 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  26.23 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  24.56 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  30.4 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  28.99 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  29.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  26.4 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  33.6 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  28.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  35.78 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  26.92 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  28.23 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1914  hypothetical protein  25.44 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2915  protein of unknown function DUF177  30.61 
 
 		 214 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>