97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3836 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3836  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1643  hypothetical protein  97.71 
 
 
175 aa  315  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17907  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4161  hypothetical protein  90.86 
 
 
175 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1910  hypothetical protein  85.14 
 
 
175 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000222818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3804  hypothetical protein  84.57 
 
 
175 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1521  hypothetical protein  85.71 
 
 
175 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1486  hypothetical protein  84.57 
 
 
175 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  76 
 
 
175 aa  271  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  75.43 
 
 
175 aa  262  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  59.55 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  59.55 
 
 
178 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  34.3 
 
 
173 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  36.36 
 
 
173 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  32.95 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985112  hitchhiker  0.0000661717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000145299  hitchhiker  0.00000000000156783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000850849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  0.000000000000230682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  0.00000000052483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  29.34 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.0000303245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  29.34 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  29.34 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000784281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  29.34 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000218944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  30.54 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000120656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  30.95 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  34.72 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000257627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  28.74 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  32.74 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  30.99 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  31.28 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  32 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  30.23 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  30.99 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000831476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  35.25 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  35.25 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722055  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  35.25 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000825555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  36.07 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000844005  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  30.99 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  30.41 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000408475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  31.95 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  31.95 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  31.95 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  29.48 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  31.95 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  31.95 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  28.16 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02913  hypothetical protein  30.18 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1871  hypothetical protein  33.71 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002991  hypothetical protein YceD (clustered with ribosomal protein L32p)  30.18 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000352576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  33.53 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  30.26 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  28.57 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  28.65 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  28.81 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  29.48 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  29.48 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  29.34 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  32.35 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  29.59 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  27.38 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1914  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  34.17 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  35.29 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  32.31 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0614  hypothetical protein  31.55 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  26.52 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  33.04 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  29.79 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1670  hypothetical protein  29.45 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  31.93 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  24.82 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  25.44 
 
 
191 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  30.18 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  31.58 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  34.78 
 
 
205 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2139  hypothetical protein  35 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  28.68 
 
 
201 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>