95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1681 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000825555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722055  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  85.55 
 
 		 173 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000257627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  85.55 
 
 		 173 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  79.77 
 
 		 173 aa  289  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  79.77 
 
 		 173 aa  289  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  88.44 
 
 		 173 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000844005  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  79.77 
 
 		 173 aa  289  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985112  hitchhiker  0.0000661717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  79.19 
 
 		 173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000784281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  79.19 
 
 		 173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.0000303245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  79.19 
 
 		 173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000203492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  79.19 
 
 		 173 aa  287  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000218944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000145299  hitchhiker  0.00000000000156783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000850849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  0.000000000000230682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  79.65 
 
 		 173 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  0.00000000052483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  78.61 
 
 		 173 aa  284  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  77.46 
 
 		 173 aa  283  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000120656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  81.5 
 
 		 173 aa  277  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  80.92 
 
 		 173 aa  277  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000831476  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  58.38 
 
 		 174 aa  210  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  51.45 
 
 		 173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  48.85 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000408475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  45.98 
 
 		 220 aa  167  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02913  hypothetical protein  45.98 
 
 		 174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002991  hypothetical protein YceD (clustered with ribosomal protein L32p)  45.98 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000352576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  43.1 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  43.02 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  41.86 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  41.28 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  42.44 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  42.44 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  40.94 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  41.86 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  41.86 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  40.7 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  40.12 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  41.28 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  40.12 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  39.53 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  39.53 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  36.93 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  36.93 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  33.14 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  35.43 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1871  hypothetical protein  32.4 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  34.52 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  29.31 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  30.06 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  34.38 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  28.74 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1486  hypothetical protein  29.34 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  38.79 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3804  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1910  hypothetical protein  29.34 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000222818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1521  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  28.24 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  30.34 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  28.24 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  29.05 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  29.71 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  36.84 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  35.78 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  27.01 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4161  hypothetical protein  28.14 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  30.06 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  29.46 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  34.86 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3836  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  27.01 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  27.17 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1643  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17907  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  26.82 
 
 		 174 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  28.48 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  35.65 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  24.86 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  33.91 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0614  hypothetical protein  48.39 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  34.4 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  34.23 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  32.46 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1914  hypothetical protein  23.84 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  31.19 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  46.67 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>