107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2915 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2915  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1069  hypothetical protein  91.71 
 
 
217 aa  358  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959716  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0825  hypothetical protein  84.65 
 
 
212 aa  295  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0527  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2910  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2483  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2799  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2795  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2856  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1806  hypothetical protein  73.11 
 
 
210 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2186  hypothetical protein  72.9 
 
 
211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.111774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1714  hypothetical protein  71.7 
 
 
210 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4230  hypothetical protein  72.43 
 
 
211 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879956  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1076  hypothetical protein  70.09 
 
 
211 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0994  hypothetical protein  70.09 
 
 
211 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0998  hypothetical protein  70.09 
 
 
211 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0638  hypothetical protein  70.09 
 
 
211 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1118  hypothetical protein  70.09 
 
 
211 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  41.84 
 
 
201 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  38.66 
 
 
178 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  41.46 
 
 
205 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  41.72 
 
 
179 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  39.69 
 
 
178 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  35.03 
 
 
183 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  35.42 
 
 
184 aa  92.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  32.65 
 
 
183 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  32.14 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  34.07 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  30.3 
 
 
184 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  35.83 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0614  hypothetical protein  34.34 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  32.97 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  30.96 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  29.17 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  26.02 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  36.31 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  29.02 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  30.1 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  26.7 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  27.98 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  31.61 
 
 
174 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  31.12 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5275  hypothetical protein  32.65 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  29.23 
 
 
174 aa  61.6  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  33.59 
 
 
174 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  33.85 
 
 
174 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  31.63 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  30.61 
 
 
174 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  30.61 
 
 
174 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  30.61 
 
 
174 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  31.12 
 
 
174 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  25.38 
 
 
166 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  30.08 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  31.12 
 
 
174 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  31.12 
 
 
174 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  35.83 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000218944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  35.83 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000784281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  35.83 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.0000303245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  35.83 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000203492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  33.59 
 
 
174 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985112  hitchhiker  0.0000661717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  28.19 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  38.26 
 
 
175 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000120656  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  33.87 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  36.07 
 
 
173 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000844005  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  30.05 
 
 
174 aa  55.5  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  0.000000000000230682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  0.00000000052483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000850849  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000145299  hitchhiker  0.00000000000156783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  27.84 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  33.61 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  32.5 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000831476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  35 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  26.87 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  30.46 
 
 
170 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  31.9 
 
 
170 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  35.48 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000825555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  35.48 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722055  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  35.48 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  30.34 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000257627  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  24.62 
 
 
171 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  30.83 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  29.85 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  28.68 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  30.7 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  31.67 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000408475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  25.39 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  33.07 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  29.03 
 
 
173 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  32.23 
 
 
173 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  29.32 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>