25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3083 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  70.54 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  70.54 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  67.18 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  69.77 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  67.69 
 
 		 138 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  77.17 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  65.89 
 
 		 137 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  62.79 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  69.53 
 
 		 135 aa  172  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  63.28 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  63.08 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  44.62 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  44.62 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  49.21 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  43.85 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  47.66 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  44.53 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  30.95 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>