27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1596 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  45.98 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  37.23 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  45.07 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  37.84 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  37.84 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  37.84 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  41.18 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  38.67 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  37.62 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  31.96 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  37.35 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  37.35 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  36.14 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  36.23 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  32.99 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  34.18 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  31.63 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  32.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1135  hypothetical protein  29.13 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  0.48515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3285  hypothetical protein  29.2 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134933  hitchhiker  0.0000129314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  29.89 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  27.37 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>