25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1147 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  40.78 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4299  hypothetical protein  40.58 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1550  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  29.79 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  26.88 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1135  hypothetical protein  32.26 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  0.48515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  26.88 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  26.88 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2639  hypothetical protein  41.27 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0373938  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3216  hypothetical protein  32.94 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3165  hypothetical protein  31.52 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  30.95 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  27.17 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  27.37 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  26.09 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  26.09 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2819  hypothetical protein  35.37 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  27.96 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  26.09 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  34.43 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.909866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3285  hypothetical protein  32.94 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134933  hitchhiker  0.0000129314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>