25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0875 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  70.77 
 
 		 128 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  62.79 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  74.11 
 
 		 135 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  64.84 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  64.84 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  64.84 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  64.06 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  64.06 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  64.06 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  62.79 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  63.28 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  66.15 
 
 		 131 aa  166  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  59.09 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  70.09 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  62.02 
 
 		 128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  39.69 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  42.42 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  40.6 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  40.15 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  40.6 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  37.88 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  37.23 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03104  hypothetical protein  27.5 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1147  hypothetical protein  29.51 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>